يقوم هذا القسم بتشخيص وعلاج جميع الأمراض التي قد تحدث في الجهاز التنفسي العلوي مثل نزلة البرد والتهاب الحلق والأمراض الحادثة في تجويف الأنف والجيوب الأنفية، وكذلك أمراض الجهاز التنفسي السفلي مثل أمراض الشعب الهوائية والرئة.
تشمل أمراض الجهاز التنفسي السفلي أيضًا:
- الأمراض الالتهابية: مثل التهاب الشعب الهوائية الحاد، والالتهاب الرئوي (ذات الرئة)، وتوسع القصبات، والسل، والتهاب الغدد اللمفاوية العنقية، والفطار، وخراج الرئة
- الأمراض التنفسية: مثل مرض الانسداد الرئوي المزمن، والربو، والتهاب الشعب الهوائية المزمن، وانتفاخ الرئة، وإعاقة تدفق الهواء المزمن الناجم عن السل الرئوي
- الأورام: مثل سرطان الرئة، وورم الرئة الحميد، وورم المنصف
- أمراض غشاء الجنب: مثل ذات الجنب، وتقيح الصدر، واسترواح الصدر
- أمراض الرئة الخلالية: مثل الالتهاب الرئوي الخلالي مجهول السبب، وأمراض المناعة الأخرى